Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmoP56726 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmoP56726 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmoP56726 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmoP56726 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmoP56726 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmoP56726 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SmoP56726 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SmoP56726 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SmoP56726 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SmoP56726 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SmoP56726 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SmoP56726 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SmoP56726 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SmoP56726 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SmoP56726 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SmoP56726 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SmoP56726 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SmoP56726 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SmoP56726 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SmoP56726 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SmoP56726 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SmoP56726 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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