Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms