Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
GferP56213 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
GferP56213 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
GferP56213 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
GferP56213 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
GferP56213 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
GferP56213 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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