Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Sh3bp1P55194 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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