Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SftpbP50405 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SftpbP50405 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SftpbP50405 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SftpbP50405 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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SftpbP50405 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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