Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Tmod1P49813 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Tmod1P49813 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Tmod1P49813 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Tmod1P49813 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Tmod1P49813 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Tmod1P49813 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Tmod1P49813 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
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