Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkn1bP46414 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms