Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Mmp9P41245 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Mmp9P41245 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Mmp9P41245 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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