Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtlP38585 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtlP38585 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtlP38585 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtlP38585 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtlP38585 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
TtlP38585 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TtlP38585 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
TtlP38585 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtlP38585 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtlP38585 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms