Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab5cP35278 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab5cP35278 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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