Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nedd1P33215 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms