Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms