Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SsbP32067 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SsbP32067 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SsbP32067 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SsbP32067 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SsbP32067 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms