Protein–RNA interactions for Protein: P31315

Gsx1, GS homeobox 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx1P31315 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gsx1P31315 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gsx1P31315 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gsx1P31315 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsx1P31315 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms