Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VtnP29788 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VtnP29788 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms