Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxrgP28705 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms