Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PdgfraP26618 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PdgfraP26618 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PdgfraP26618 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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