Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CftrP26361 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CftrP26361 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CftrP26361 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CftrP26361 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CftrP26361 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CftrP26361 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CftrP26361 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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