Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ggta1P23336 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms