Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a2P20490 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms