Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou5f1P20263 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms