Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NefhP19246 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NefhP19246 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NefhP19246 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NefhP19246 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NefhP19246 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NefhP19246 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NefhP19246 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NefhP19246 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NefhP19246 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NefhP19246 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NefhP19246 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NefhP19246 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NefhP19246 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NefhP19246 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NefhP19246 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NefhP19246 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NefhP19246 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NefhP19246 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NefhP19246 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms