Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtpraP18052 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpraP18052 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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