Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
PcnaP17918 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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PcnaP17918 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PcnaP17918 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PcnaP17918 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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