Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd5P13379 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms