Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb1P13372 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms