Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms