Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tnp1P10856 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms