Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01747 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
P01747 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01747 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01747 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01747 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01747 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01747 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01747 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01747 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01747 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01747 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01747 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01747 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01747 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P01747 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
P01747 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
P01747 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
P01747 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
P01747 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
P01747 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
P01747 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
P01747 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
P01747 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
P01747 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P01747 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P01747 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms