Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sp1O89090 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sp1O89090 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sp1O89090 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sp1O89090 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sp1O89090 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sp1O89090 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sp1O89090 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Sp1O89090 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms