Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sap30O88574 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms