Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptpn20O55082 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms