Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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