Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rdh16O54909 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rdh16O54909 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rdh16O54909 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rdh16O54909 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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