Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cited2O35740 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cited2O35740 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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