Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Slc18a3O35304 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms