Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp35M0QWN7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp35M0QWN7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp35M0QWN7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp35M0QWN7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp35M0QWN7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp35M0QWN7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Usp35M0QWN7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usp35M0QWN7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usp35M0QWN7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usp35M0QWN7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usp35M0QWN7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usp35M0QWN7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usp35M0QWN7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp35M0QWN7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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