Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Gm379J3QQ19 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Gm379J3QQ19 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Gm379J3QQ19 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Gm379J3QQ19 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Gm379J3QQ19 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Gm379J3QQ19 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Gm379J3QQ19 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm379J3QQ19 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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Gm379J3QQ19 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms