Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm5849J3QPE5 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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