Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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E030018B13RikJ3QMS9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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E030018B13RikJ3QMS9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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E030018B13RikJ3QMS9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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E030018B13RikJ3QMS9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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