Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm21818J3KMS6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm21818J3KMS6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm21818J3KMS6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm21818J3KMS6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm21818J3KMS6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Gm21818J3KMS6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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