Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm20830J3KML6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20830J3KML6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms