Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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