Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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H2-M1F7CXU4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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H2-M1F7CXU4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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H2-M1F7CXU4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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H2-M1F7CXU4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-M1F7CXU4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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