Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm2564F6Z9S8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms