Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Igkv1-99F6XWB2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms