Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SmgcF6VRN1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SmgcF6VRN1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms