Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms