Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm340F6RGI3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm340F6RGI3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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