Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Taf4E9QAP7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4E9QAP7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms